Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms