Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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