Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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