Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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