Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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