Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms