Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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HMGN3Q15651 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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HMGN3Q15651 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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HMGN3Q15651 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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HMGN3Q15651 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGN3Q15651 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HMGN3Q15651 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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