Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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