Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM29Q14134 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM29Q14134 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms