Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB31Q13636 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms