Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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