Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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