Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SCGB2A2Q13296 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SCGB2A2Q13296 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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