Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPPAQ13219 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPPAQ13219 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms