Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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