Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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