Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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