Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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