Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EP300Q09472 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EP300Q09472 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms