Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms