Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms