Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms