Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms