Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms