Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms