Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDR2Q01850 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms