Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms