Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms