Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIP4K2BP78356 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2BP78356 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2BP78356 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2BP78356 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2BP78356 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms