Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms