Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXG1P55316 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms