Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms