Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms