Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC6A9P48067 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms