Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPR4P46093 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPR4P46093 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPR4P46093 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPR4P46093 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPR4P46093 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms