Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms