Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPOP42166 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPOP42166 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms