Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms