Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA3P35244 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA3P35244 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA3P35244 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA3P35244 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA3P35244 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms