Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF1P30408 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF1P30408 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF1P30408 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF1P30408 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF1P30408 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF1P30408 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms