Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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HOXD10P28358 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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HOXD10P28358 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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