Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms