Protein–RNA interactions for Protein: P27658

COL8A1, Collagen alpha-1(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A1P27658 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL8A1P27658 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL8A1P27658 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms