Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms