Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms