Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms