Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms