Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG2P13727 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms