Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms