Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms